Divergência de valores no ct-e

Bom dia.
Temos percebido que os valores que estão refletindo em nossa loja pela API com o ct-e emitido pela transportadora não é o mesmo.
Já me informaram que não teve alteração na tabela. Preciso, por favor, que seja verificado o motivo de o ct-e ser sempre emitido a mais que o valor que sai na cotação da compra do cliente.